有業內專家表示，新能源在快速發展的同時也顯露出了很多深層次的系統性矛盾，總體上說，技術領域的研發和創新是新能源發展中的短板。政府對新能源電力的補貼機制和資金使用效率上還不到位。

至今我國的新能源產業仍被看做是補充能源，僅考慮滿足用電增量，并未達成將新能源代替石化等不可再生能源的共識。“自發自用。余量上網”的模式剛啟動，具體程式還要進一步完善。且如今我國電力調度的方式不適應新能源發電并網和直接消費。

目前我國還沒有條件落實可再生能源法規定的關于可再生能源電力全額保障性收購的要求，因此近年來棄風現象愈演愈烈，僅2012年全國就有超過200億千瓦時的風力發電棄風量，著實令人可惜。

分布式光伏發電并未受到大家的認可，在無障礙并網方面存在一定的困難。新能源產業的技術和研發等領域還未成熟，政府方面，相應的補貼政策也有待改進。另外企業方面也有一定問題，一些企業不重視技術經濟可行性，盲目擴張，地方政府的保護措施，都是導致企業不良發展的誘因。這些原因在某種程度上影響了新能源產業的發展，嚴重估計，可能會因此影響規劃目標的實現。